Отделение онкологии и радиотерапии НИИ патологии кровообращения имени академика Мешалкина находится в 1-м корпусе на улице Речкуновской, 15. Здесь проводится терапевтическое и хирургическое лечение пациентов с доброкачественными и злокачественными новообразованиями сердечно-сосудистой системы и других органов и систем. В отделении работают квалифицированные онкологи, радиологи, сосудистые хирурги. Отделение начало работать в 2010 году